極性改性反相色譜柱通過(guò)在十八烷基與硅膠之間嵌入極性基團(tuán)降低了十八烷基的疏水性，而且極性基團(tuán)具有和化合物和氫鍵易發(fā)生作用的特性。并且具有孤對(duì)電子，根據(jù)化合物的電子狀態(tài)，會(huì)產(chǎn)生吸引或者排斥的作用力。因此有與普通的色譜柱，或者具有π電子作用的苯基柱不同的選擇性，對(duì)親水性化合物的保留也增強(qiáng)。